"БИОБАНКИ КАК БИБЛИОТЕКИ: НЕ ЗНАЯ ЯЗЫКА, МЫ НЕ СМОЖЕМ ПРОЧИТАТЬ КНИГУ – НЕ ЗНАЯ ТЕХНОЛОГИЙ, МЫ НЕ СМОЖЕМ ИЗУЧАТЬ ОБРАЗЦЫ БИОМАТЕРИАЛОВ": ВТОРОЙ ДЕНЬ СИМПОЗИУМА "БИОРЕСУРСНЫЕ КОЛЛЕКЦИИ И ГЕНОМНЫЙ БИОБАНКИ"

Симпозиум "Биоресурсные коллекции и геномные биобанки" 21-22 июня работал в рамках Международного Конгресса "VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров".

Второй день работы начался с сообщения о том, что некоторые исследователи не смогли присутствовать на мероприятии и доверили коллегам представить свои исследования. А глава подразделения сервисных лабораторий и биобанка в Международном агентстве по изучению рака Всемирной организации здравоохранения, Зисис Козлакидис (Zisis Kozlakidis) записал видео-презентацию своего выступления, так как не смог приехать на Конгресс по причине отказа в визе.

Д.б.н. Андрей Львович Мулюкин представил работу Николая Викторовича Пименова "Общее состояние и перспективы развития коллекций микроорганизмов в учреждениях ФАНО/МНВО". Андрей Львович рассказал о самых крупных коллекциях России, географии их расположения и особенностям. Особое внимание было уделено миссиям и практическому применению таких коллекций, а также перспективам развития и финансирования. Затем Андрей Львович рассказал про своё исследование "Коллекция уникальных и экстремофильных микроорганизмов (UNIQEM)/ Значение выживания микробов в природных и созданных биобанках". Доклад был посвящён особенностям UNIQEM, специфическим исследованиям и экспериментам на ее основе. Сотрудники центра коллективного пользования изучают строение клеток новых штаммов, используют электронную микроскопию и рентгеновский микроанализ, изучают наночастицы и состояние покоя у неспорообразующих бактерий. Участники симпозиума активно задавали вопросы о положении коллекции в структуре института, а также способах сохранения образцов.

К.б.н. Людмила Валерьевна Чистякова рассказала об ассортименте, условиях культивирования и переборной базе коллекции ресурсного центра "Культивирование микроорганизмов" Научного парка СПбГУ. В докладе Людмила Валерьевна акцентировала внимание на коллекции цианобактерий, микроводорослей и паразитов водорослей (CALU).

Своими исследованиями на базе "Биобанка микрофлоры для персонификационной микробной терапии" поделился член-корр. РАН Александр Николаевич Суворов, который рассказал, как бороться с определенными биотическими состояниями (например, с дизбиозом), восстановить микробиоту и проводить персонифицированную микробную терапию для лечения больных. "Микробная терапия с помощью аутопробиотиков увеличивает содержание полезных бактерий и резко снижает бактерии, приводящие к заболеванию", – подытожил профессор. На вопрос можно ли создать некий набор бактерий, который подходил бы каждому, Александр Николаевич ответил отрицательно. "Наша иммунная система индивидуальна, поэтому мы не можем лечить всех больных одним и тем же набором аутопробиотиков", –заключил учёный.

В ходе исследования к.б.н. Веры Игоревной Сафроновой "Генетическое биоразнообразие ризобиальных штаммов, выделенных из клубеньков реликтовых бобовых растений и депонированных в коллекции полезных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения (ВКСМ)" выяснилось, что совокупная локализация в растительных клетках штаммов в клубеньках Glyzyrrhiza (солодки) сопровождалась значительным повышением эффективности симбиоза.

Д.б.н. Мария Станиславовна Клюкина представляла доклад "Специализированная коллекция алканотрофов: современный статус, характеристика и эволюция" Ирины Борисовны Ившиной. Коллекция представлена 3 000 штаммами и также является образовательным центром. "Мы отбираем ребят, для которых наука – дело всей жизни, проводим летнюю практику для студентов Оксфордского университета в течение последних 5 лет", –пояснила Мария Станиславовна.

На симпозиуме выступил с докладом президент одного из ведущих европейских обществ в области биобанкирования (BBMRI-ERIC) Эрик Стейнфилдер. Он рассказал о значении мультицентровых исследований и предложил сотрудничество в разнообразных сферах, прежде всего, в повышении стандартов качества и ИТ.

Завершил вторую часть симпозиума его председатель, д.б.н. Андрей Сергеевич Глотов. Он рассказал об омиксных исследованиях на базе биоколлекции пациентов с акушерскими патологиями. "Перед нами стоит серьёзная задача - развитие клинической коллекции для создания биобанка семьи", – начал он своё выступление. Андрей Сергеевич говорил о составе коллекции, перспективах её развития, механизмах, по которым осуществляется обработка и хранение материалов. Также были показаны результаты исследования транскриптомов микро-РНК (прежде всего плаценты), которые подтвердили, что существуют определенные изменения уровня микро-РНК, которые связаны с риском развития преэклампсии.

Третья часть ассоциированного симпозиума была посвящена биобанкам, работающим с биообразцами человека.

Д.б.н. Владимир Николаевич Харьков говорил о геномных проектах на базе биобанка НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ. Коллекция включает в себя образцы (ДНК и кровь) представителей более 60 различных этнических групп. Сотрудники биобанка постоянно пополняют ассортимент коллекции, проводя экспедиции по сбору материала, в основном у карелов, вепсов, удмуртов и народов Сибири.

О перспективах сотрудничества с европейскими и мировыми партнерами в области биобанковских исследований рассказала проф. Каринэ Саргсян. Были представлены интересные планы по информатизации биобанков, предложены пути их реализации. Профессор представляла самый крупный биобанк в Европе "GRAZ", в котором насчитывается 25 млн. образцов. Она также рассказала о международных стандартах регистрации банков. "Биобанки похожи на библиотеки, – уверена Каринэ Саргсян. - Не зная языка, мы не сможем прочитать книгу, так и с биоматериалом: не зная технологий, мы не сможем изучать образцы".

О перспективах развития отечественной сети биобанков России говорил Артём Игоревич Муравьев. Исследователь поделился наблюдениями о географии размещения биобанков, их структуре, основах интеграции друг с другом и возможностях обмена образцами. "Настоящих биобанков в России около 20-25, потому что остальные коллекции называют себя медицинскими центрами", – заключил Артём Игоревич.

В симпозиуме приняли участие и учёные из Эстонии. Доктор Tonu Esko рассказал об исследованиях Эстонского Биобанка. В его докладе "Геномика в здравоохранении – эстонская перспектива" пристальное внимание уделяется изучению генов и способам сбора образцов. На методы сбора материалов влияет глобализация и информатизация общества, поэтому очень важно идти в ногу со временем. "Общество очень информатизировано. Сейчас все студенты имеют электронные карты, мы можем оплачивать счета дистанционно, все происходит благодаря технике", – рассказывал доктор.

Обсуждались и требования к хранению материала, о которых говорила Оксана Викторовна Сивакова. Процедуры первичной обработки материала, проблемы, связанные с определением качества образцов сыворотки и плазмы крови, – именно об этом шла речь в докладе "Современные технологии контроля качества биобанкирования".

Следующим докладчиком стала Светлана Олеговна Строкова. Ученый поделилась исследованиями Биобанка в Национальном центре акушерства, гинекологии и перинатологии. "Из 1 пробирки крови мы можем получить 18 образцов", – почеркнула Светлана Олеговна.

"Диабет 2 типа – это эпидемия. В России этим заболеванием болеет около 3,7 млн. чел, в Эстонии 9%", – с этой решительной фразы начала доклад к.б.н. Юлия Алмазовна Насыхова. В работе "Создание биобанка биоматериала пациентов с диабетом II типа в рамках программы Российско-Эстонского приграничного сотрудничества" Юлия Насыхова поделилась опытом осуществления в СПбГУ проекта, целью которого является увеличение знаний о диабете 2 типа. Она также рассказала о том, как составляется анкета пациента и о проводимых этапах исследования. Проект стартовал в мае 2019 г., планируется сформировать коллекцию образцов крови, плазмы, сыворотки пациентов с диагнозом диабет 2 типа.

С рассказом об уникальном проекте выступила к.б.н. Светлана Вячеславовна Апалько, которая представила сведения о биобанке, расположенном на базе больницы № 40. "Создание базы биомаркеров – наша основная задача. Наша больница расширяется, мы уже проводим диагностические исследования определения соматических мутаций в онкологических тканях", – поделилась Светлана Вячеславовна. Подобнее об исследованиях центра Светлана рассказала в своей работе: "Биобанк как источник трансляционных исследований и ключевой инструмент персонализированной медицины".

Мария Александровна Богданова рассказала об алгоритме ведения банка доноров спермы, критериях отбора доноров и условиях хранения биологического секрета. В докладе "Роль биобанков при проведении геномных скрининговых программ в ЭКО и пренатальной диагностике" Мария Александровна описала системы витрификации и контаминации, а также способы их избежать.

Заключительным участником 2х дневного симпозиума стал Максат Жабагин, который представил работу проф. Раушан Биномовны Исаевой "На пути к созданию национального биобанка республики Казахстан: правовое и этическое регулирование". Результатом проекта, о котором говорил Максат Жабагин, стало создание в Казахстане Центральной комиссии по биобанкам. Исследователь убежден в необходимости создавать биобанки по сбору образцов на базе всех больниц, так как это способствует развитию и здравоохранения, и науки в целом.

Ассоциированный симпозиум "Биоресурсные коллекции и геномные биобанки" закончился дискуссией. Одной из инициатив стало предложение о вхождении России в Европейское мировое сообщество микробных коллекций. Также обсуждались вопросы правового регулирования и финансирования биобанков. Участники предложили учредить конкурсную платформу, чтобы у исследователей была возможность получить гранты на финансирование коллекции.

DESIGN.............................ANDREY KHARCHEVICH
WEBMASTER